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核盘菌一分支酸变位酶同源效应蛋白的亚细胞定位

时间:2022-04-08 08:29:07 来源:网友投稿

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ki--Hm秦/yajayyh&Z 0\fzkjǰjޕ^w'材料与方法

1.1 材料

核盘菌S.sclerotiorum由德克萨斯农工大学教授Dickman提供,保存于含PDA培养基的试管内;绿色荧光蛋白GFP基因来自质粒pBluntNAT-GFP1-1;潮霉素抗性基因hph来自质粒 PUC-ATPH;引物XS1-1:5′-GCAAGGAGGATCCTAATAGAATC-3′;XS1-2:5′-TCCCCCCGGGGCAT-GTTGTTCCATTAGGAAGG-3′为自行设计,用于扩增基因启动区+信号肽(SP)+叶绿体定位肽(CTP)部分,并于两引物5′端分别增加了BamHⅠ和XmaⅠ酶切位点;根据潮霉素基因序列设计了筛选引物Hph1和Hph2,Hph1: 5′-ATGAAAAAGCCTGAACTC-3′;Hph2:5′-CTATTCCTTTGCCCTCGG-3′。

1.2 试验方法

1.2.1 生物信息学分析

分别通过SignalP 4.1 Server、PredictNLS和ChloroP 1.1 Server等生物信息学工具对核盘菌的一分支酸变位酶同源效应子的信号肽、细胞定位特征进行分析。

1.2.2 基因片段的扩增及载体的构建

收集PDA培養的核盘菌菌丝,提取DNA,然后依据所设计的引物XS1-1和XS1-2扩增核盘菌分支酸变位酶同源基因的启动区+信号肽(SP)+叶绿体定位肽(CTP)的930 bp的DNA序列,将所得DNA片段与GFP基因融合构建转化载体。方法为:以pBluntNAT-GFP1-1为基础,插入真菌筛选标记潮霉素抗性基因,再将经PCR克隆获得的含启动子(N-Pro)+信号肽(SP)+叶绿体定位肽(CTP)的DNA片段连入载体中,构建得到启动子+SP+CTP+GFP融合载体pBluntNAT-PSC-GFP。

1.2.3 遗传转化及转化子筛选

酶解法制备核盘菌原生质体,将融合载体通过REMI技术转化核盘菌原生质体,300 μg/mL潮霉素筛选转化子,并提取转化子DNA,采用引物Hph1和Hph2进行 PCR,验证潮霉素抗性基因在核盘菌基因组上的整合,最后通过荧光显微镜检测GFP表达与否[13]。

1.2.4 效应蛋白的分泌特性及植物细胞定位分析

接种GFP能够正常表达转化子的菌丝于烟草叶片,通过荧光共聚焦显微镜检测荧光信号,分析其分泌特性和细胞定位。

2 结果与分析

2.1 信号肽及定位信号预测结果

通过SignalP 4.1 Server、PredictNLS 和ChloroP 1.1 Server等在线软件对该效应蛋白进行分析,发现该蛋白具有20个氨基酸组成的信号肽(SP)序列,并且具有包含45个氨基酸的叶绿体定位肽(CTP)序列特征,二者的氨基酸残基序列如图1所示:

图1 预测的效应蛋白信号肽和叶绿体

定位肽氨基酸序列

Fig.1 The SP and CTP of the effector

2.2 GFP融合载体的构建

2.2.1 启动子+SP+CTP序列的扩增

采用引物对XS1-1/XS1-2进行PCR扩增,获得长度约900 bp的DNA序列,如图2所示。

图2 效应子的启动子、信号肽、叶绿体定位肽序列的

PCR产物电泳分析结果

Fig.2 Agarose gel electrophoresis of PCR product

of the promoter+SP+CTP

经测序表明,该片段全长为938 bp,与预测的一致,包含分支酸变位酶基因740 bp的上游启动区序列+信号肽序列+叶绿体定位肽序列,该DNA片段包含预测的启动子元件CAAT Box和相应的信号肽、叶绿体定位肽序列,序列结果如图3所示:

图3 启动子、信号肽和定位肽DNA序列

Fig.3 DNA sequence of the promoter+SP+CTP

2.2.2 GFP融合载体的构建

将潮霉素抗性基因hph插入pBluntNAT-GFP1-1中,再分别将经PCR克隆获得的上述启动子(N-Pro)+信号肽(SP)+叶绿体定位肽(CTP)的一DNA片段连入载体中,构建得到启动子+SP+CTP+GFP融合载体,具体操作步骤如图4所示。

2.3 转化子的筛选与验证

将上述载体经REMI介导的技术转化核盘菌原生质体,筛选到了在含有300 μg/mL潮霉素的PDA培养基上生长的转化子,提取转化子DNA,以Hph1/Hph2为引物经PCR验证,扩增到了预期条带(图5),表明转化子中载体已整合到基因组中。

图4 融合载体构建流程图

Fig.4 Construction of the vector

图5 PCR检测转化子中潮霉素抗性基因

Fig.5 Detection of hph gene in transformants by

PCR amplification

2.4 荧光蛋白细胞定位分析结果

将Natural Pro+SP+CTP+GFP融合载体转化获得的转化子菌丝接种到烟草叶片上,经荧光显微镜检测发现GFP荧光蛋白均能正常表达,并且发现荧光蛋白具有分泌到菌丝外的现象(图6)。

图6 融合GFP蛋白的表达及分泌性检测

Fig.6 Expression and secretion of the fusion GFP protein

经转化子接种的烟草叶片在56 h后进一步检测叶片中荧光分布,同时制备烟草叶片原生质体,并通过荧光共聚焦显微镜检测,发现GFP荧光和叶绿体自体荧光能够共定位,GFP荧光蛋白有在细胞叶绿体内聚集现象(图7~8)。

3 结论与讨论

通过试验我们得到了能够正常表达GFP融合蛋白的转化子,该融合蛋白包含核盘菌分支酸变位酶同源蛋白的信号肽和叶绿体定位肽。经过接种转化子菌丝于烟草叶片后对荧光信号的检测发现该融合蛋白能夠正常表达、具有分泌性并聚集于烟草叶片细胞中的叶绿体处。由此推测该分支酸变位酶同源蛋白发挥作用的部位可能是在叶绿体,可能通过影响光合产物中分支酸衍生物的合成,从而影响寄主防御反应。

图7 GFP融合蛋白的荧光定位检测结果

Fig.7 Subcellular localization of the fusion GFP protein

图8 接种转化子的烟草原生质体内融合GFP荧光检测结果

Fig.8 Subcellular localization of the fusion GFP protein

分支酸衍生物 (chorismate derived compounds, CDCs) 在植物的生长、发育、防御及与其他生物的互作中起重要作用[14],特别是水杨酸(SA)信号通路是植物体内重要的抗性相关信号通路[15],在对活体寄生病原物的防御中发挥重要作用[16]。

莽草酸途径(shikimate pathway)是微生物和植物的基本代谢途径,其终产物是分支酸 (chorismate)[17]。分支酸是生物中许多化合物的前体, 包括芳香族氨基酸 (如苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)、水杨酸 (SA)、IAA及其他次生代谢物[18]。

分支酸变位酶 (chorismate mutase, CM)催化分支酸转化成预苯酸, 为苯丙氨酸与酪氨酸的合成提供前体,从而改变分支酸进一步转化路径,影响体内水杨酸的水平及其植物抗性水平[19]。对于寄生性的病原微生物来讲,其所需要的苯丙氨酸和络氨酸可以从寄主获得,分支酸变位酶对于自身氨基酸代谢可能并不是必需的。但通过NCBI数据库中BLAST发现该类基因在部分真菌如黑粉菌Ustilago maydis、核盘菌Sclerotinia sclerotiorum等的部分病原微生物体内存在,推测可能在植物病原菌与植物的联系中发挥作用。研究也证明了在专性寄生的黑粉菌中分支酸变位酶基因Cmu1与其致病性密切相关,植物感病后其水杨酸水平显著下降[19]。生物信息学分析发现在死体营养的病原物中仅核盘菌具有分支酸变位酶同源基因,前期研究表明该基因与致病性相关,但对其如何发挥作用还不清楚。通常认为植物对死体营养病原物的抗性过程中水杨酸通路并不发挥主要作用[16],因此对于该基因如何在核盘菌与寄主植物互作过程中发挥作用值得进一步深入探索。

参考文献

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(责任编辑: 杨明丽)

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